个人所得税是按应发工资来填入，也就是计提的工资来填入，然后再填入应由个人负担的社保费用，公积金，各类专项扣除等，用应发工资减去各项扣除，得到个人所得税应纳税所得额，然后根据对应税率计算得到个税的应纳税额。