个人所得税需要补缴的，可以根据实际情况来补缴，比如员工的工资少申报了，需要补缴，可以由企业更正申报个人所得税。如果是汇算清缴时，计算的个人所得税比实际的已经缴纳的税额要多，形成需要补缴的金额的，个人可以通过自然人申报管理系统进行补缴。